往日不再地下避难所分布在各区域的埋伏营地内，清理营地敌人后，在特定位置可找到圆形井盖式入口，进入後能獲取地圖與物資。
贝尔溪温泉营地的地下避难所位于营地西侧山壁旁，靠近出入口位置，找到圆形井盖即可进入。贝纳普洞穴营地的避难所在山顶敌人较少一侧，异变者睡觉山洞正上方，狙擊手營地另一側位置。貝納普營地避難所則在營地最深處靠近篝火區域。
探索地下避難所前，需先清空營地所有暴徒，避免探索時遭受偷襲。營地外圍存在捕熊夾與警報陷阱，靠近時可解除陷阱，捕熊夾能回收利用，對敵人可造成致命傷害。由于營地無警報系統，敵人不會觸發增援，可選擇潛行或正面作戰兩種方式。
進入避難所後，沿樓梯下行，調查桌上地圖即可完成營地清理任務，解鎖周邊地圖迷霧，標注NERO檢查哨、研究區及曆史地標等重要位置。避難所內通常存有彈藥、醫療包與合成材料等物資，可補充探索消耗。清空後的營地可作爲快速移動點，方便後續區域探索。
除上述营地外，游戏中阿斯本巴特、贝尔利湖、黑火山等多个埋伏营地均设有地下避难所。这些避难所入口样式一致，均为圆形井盖结构，分布在营地边缘或建筑附近。探索时优先清理高处与远程敌人，再逐步推进至入口区域，可大幅降低探索风险。