部落冲突的药水制作需通过法术工厂与暗黑法术工厂完成，前者消耗圣水制作常规法术药水，后者消耗暗黑重油制作暗黑法术药水，需先提升大本营等级解锁对应工厂与药水配方，再投入对应资源完成配制。
大本营达到5级时可建造法术工厂，这是制作常规药水的核心建筑，法术工厂每提升一级会增加法术容量，同时解锁新的药水类型。1级法术工厂解锁雷电药水，消耗26000圣水配制，能对区域内建筑与部队造成雷电伤害；2级解锁治疗药水，消耗45000圣水，可治疗范围内友军部队与英雄；3级解锁狂暴药水，消耗70000圣水，能提升范围内友军的攻击与移动速度；4级解锁跳跃药水，消耗120000圣水，让部队可跨越城墙；5级解锁隐形药水，消耗150000圣水，使范围内部队短暂隐形，避开防御建筑锁定。法术工厂升级时不影响药水配制，可同时进行，配制好的药水会储存在工厂内，战斗时可直接携带使用。
大本营升至8级后可建造暗黑法术工厂，专门制作暗黑重油类药水，这类药水效果更偏向控制與持續傷害。1級暗黑法術工廠解鎖毒藥藥水，消耗750暗黑重油，能減速並持續傷害範圍內敵方部隊與英雄；2級解鎖急速藥水，消耗900暗黑重油，大幅提升友軍移動與攻擊速度，效果強于狂暴藥水；3級解鎖冰凍藥水，消耗1200暗黑重油，可凍結敵方防禦建築與部隊，使其暫時無法攻擊；4級解鎖召回藥水，消耗1500暗黑重油，能將範圍內友軍部隊召回並重置狀態；5級解鎖複蘇藥水，消耗1800暗黑重油，可複活範圍內被擊殺的英雄；6級解鎖蔓生藥水，消耗2200暗黑重油，能生成藤蔓阻礙敵方部隊移動並造成持續傷害。暗黑法術工廠同樣可在升級時配制藥水，與常規法術工廠相互獨立，共同組成完整的藥水配制體系。
藥水制作需合理規劃資源與容量，前期大本營等級較低時，優先升級法術工廠至3級，解鎖雷電、治療、狂暴三種核心藥水，滿足日常進攻與部落戰基礎需求，此時可多儲備雷電與治療藥水，適配胖子、法師等常規流派。中期大本营8级后，重点升级暗黑法术工厂，优先解锁毒药与冰冻药水，毒药可克制敌方援军与英雄，冰冻能关键控制核心防御，适配石法、皮法等流派。后期高本阶段，全面提升两类工厂等级，解锁全部药水类型，根据不同进攻流派灵活搭配，比如天女流搭配隐形、冰冻药水，狗球流搭配急速、毒药药水。同时要注意法术容量限制，高本时可通过升级工厂与建造额外工厂提升容量，确保战斗时能携带足够多的药水，发挥最大战术效果。
除了主动配制，药水也可通过部落战奖励、活动任务、宝箱开启等方式获取，但自制仍是最稳定的来源，日常需保证圣水与暗黑重油储备，优先满足高优先级药水的配制，避免战斗时出现药水短缺的情况。